LipidSearch 5.2 تحلیل داده های لیپیدومیکس

نرم افزار LipidSearch محصول شرکت Thermo Fisher Scientific یک پلتفرم تخصصی برای شناسایی، حاشیه نویسی (Annotation)، کمّی سازی نسبی و تحلیل آماری ترکیبات لیپیدی در مطالعات لیپیدومیکس (Lipidomics) است. این نرم افزار به طور اختصاصی برای پردازش داده های طیف سنجی جرمی حاصل از سامانه های LC-MS/MS توسعه یافته و به ویژه با طیف سنج های Orbitrap، Tribrid، Ion Trap و Triple Quadrupole شرکت Thermo Fisher یکپارچگی کامل دارد.

LipidSearch یک محیط جامع برای تبدیل داده های خام طیف سنجی جرمی به اطلاعات زیستی قابل تفسیر فراهم می کند. این نرم افزار از مرحله تشخیص پیک ها، هم ترازی زمانی (Retention Time Alignment)، شناسایی گونه های لیپیدی، کمّی سازی نسبی، تحلیل آماری و تولید گزارش های نهایی را در قالب یک گردش کار خودکار انجام می دهد و زمان مورد نیاز برای پردازش پروژه های بزرگ لیپیدومیکس را به میزان قابل توجهی کاهش می دهد.

هسته اصلی LipidSearch بر پایه یکی از بزرگ ترین پایگاه های داده تخصصی لیپیدها توسعه یافته که بیش از 1.5 میلیون یون لیپیدی، آداکت ها و الگوهای پیش بینی شده شکست (Fragmentation Patterns) را در بر می گیرد. الگوریتم های اختصاصی نرم افزار با مقایسه طیف های MS/MS با این بانک اطلاعاتی، گونه های مختلف فسفولیپیدها، اسفینگولیپیدها، گلیسرولیپیدها، اسیدهای چرب، استرول ها و سایر کلاس های لیپیدی را با اطمینان بالا شناسایی می کنند.

یکی از مهم ترین مزیت های این نرم افزار، استفاده همزمان از اطلاعات حاصل از شکست های CID، HCD و داده های MS² و MS³ در سامانه های Tribrid و Orbitrap است. این رویکرد باعث افزایش دقت شناسایی، کاهش مثبت کاذب و بهبود تفکیک گونه های لیپیدی با ساختارهای مشابه می شود که در مطالعات متابولومیکس، پزشکی دقیق و کشف زیست نشانگرها اهمیت بالایی دارد.

LipidSearch علاوه بر شناسایی ترکیبات، ابزارهای آماری و مصورسازی متنوعی برای مقایسه گروه های آزمایشی، تحلیل اختلافات بیان لیپیدها و استخراج زیست نشانگرهای بالقوه ارائه می دهد. به همین دلیل این نرم افزار در تحقیقات سرطان، بیماری های متابولیک، علوم اعصاب، ایمنی شناسی، زیست فناوری، داروسازی و پزشکی ترجمه ای به عنوان یکی از استانداردهای تحلیل داده های لیپیدومیکس شناخته می شود.

قابلیت‌های نرم افزار LipidSearch

• شناسایی خودکار لیپیدها | Automated Lipid Identification
  شناسایی خودکار گونه های مختلف لیپیدی با استفاده از الگوریتم های اختصاصی و تطبیق داده های MS/MS با بانک اطلاعاتی جامع لیپیدها. نرم افزار کلاس های مختلف لیپید را با دقت بالا تفکیک کرده و احتمال شناسایی هر ترکیب را بر اساس سیستم امتیازدهی ارزیابی می کند.
• پایگاه داده جامع لیپیدها | Comprehensive Lipid Database
  استفاده از بانک اطلاعاتی شامل بیش از 1.5 میلیون یون لیپیدی، آداکت ها و الگوهای شکست پیش بینی شده که امکان شناسایی طیف گسترده ای از کلاس های لیپیدی را فراهم می سازد.
• تشخیص هوشمند پیک ها | Smart Peak Detection
  استخراج خودکار پیک های طیف جرمی با استفاده از الگوریتم های حذف نویز، صاف سازی سیگنال و تفکیک پیک های هم پوشان برای افزایش دقت شناسایی و کمّی سازی.
• هم ترازی زمانی نمونه ها | Retention Time Alignment
  هم ترازی زمان بازداری میان نمونه های مختلف LC-MS به منظور حذف تغییرات کروماتوگرافی و افزایش دقت مقایسه داده ها در پروژه های چند نمونه ای.
• کمّی سازی نسبی لیپیدها | Relative Lipid Quantitation
  محاسبه فراوانی نسبی گونه های لیپیدی بر اساس انتگرال گیری از کروماتوگرام یون استخراج شده (XIC) و مقایسه تغییرات بیان لیپیدها بین گروه های آزمایشی.
• تحلیل آماری داده ها | Statistical Data Analysis
  اجرای آزمون های آماری، مقایسه گروه های نمونه، نمایش نمودارهای آماری و شناسایی لیپیدهایی که تغییرات معنی دار زیستی یا بالینی دارند.
• پشتیبانی از طیف سنجی پیشرفته | Advanced MS/MS Support
  پشتیبانی از داده های حاصل از CID، HCD، MS² و MS³ و ترکیب اطلاعات حاصل از چند نوع شکست برای افزایش اطمینان در شناسایی ساختارهای لیپیدی.
• حاشیه نویسی ساختار لیپیدها | Lipid Annotation
  تخصیص خودکار نام، کلاس، ترکیب اسیدهای چرب، نوع آداکت و سایر مشخصات ساختاری به گونه های لیپیدی شناسایی شده بر اساس بانک اطلاعاتی نرم افزار.
• مدیریت پروژه های لیپیدومیکس | Lipidomics Project Management
  سازماندهی مجموعه داده های بزرگ، مدیریت گروه های نمونه، کنترل فرآیند تحلیل و نگهداری نتایج در قالب پروژه های تحقیقاتی چند مرحله ای.
• گزارش گیری و مصورسازی نتایج | Reporting and Data Visualization
  تولید گزارش های تحلیلی، جداول مقایسه ای و نمودارهای آماری برای ارائه نتایج پژوهش، انتشار مقالات علمی و تفسیر داده های لیپیدومیکس.

کاربردهای تخصصی

• صنایع داروسازی و زیست فناوری
  به منظور بررسی تغییرات پروفایل لیپیدی در فرآیند توسعه دارو، ارزیابی پاسخ متابولیکی به ترکیبات دارویی، مطالعات فارماکودینامیک و شناسایی نشانگرهای زیستی در مراحل تحقیق و توسعه.
• آزمایشگاه های لیپیدومیکس و متابولومیکس
  به منظور شناسایی، طبقه بندی و کمّی سازی هزاران گونه لیپیدی در نمونه های زیستی با استفاده از داده های LC-MS/MS و تولید پروفایل های جامع لیپیدی.
• آزمایشگاه های کنترل کیفیت و توسعه روش های تحلیلی
  به منظور اعتبارسنجی روش های کروماتوگرافی و طیف سنجی جرمی، ارزیابی تکرارپذیری نتایج و مقایسه ترکیب لیپیدی نمونه های مختلف در فرآیندهای تحقیقاتی و صنعتی.
• مراکز تحقیق و توسعه علوم زیستی
  به منظور مطالعه مسیرهای متابولیسم لیپیدها، بررسی اثر عوامل محیطی یا ژنتیکی بر ترکیب لیپیدی سلول ها و تحلیل داده های حاصل از پروژه های زیست شناسی سامانه ها.
• آزمایشگاه های بیوشیمی و زیست شناسی مولکولی
  به منظور تحلیل تغییرات ترکیبات لیپیدی در بافت ها، سلول ها و مایعات زیستی، مقایسه نمونه های آزمایشی و استخراج داده های کمی برای پروژه های تحقیقاتی.

✅ بیشتر بخوانید: BioPharma Finder تحلیل طیف سنجی بیوداروها

برای مشاهده اطلاعات کامل نرم افزار LipidSearch به منظور تحلیل داده های لیپیدومیکس به اینجا مراجعه کنید.