MetaboScape 2026 شتاب دهنده تست های بیوشیمی

MetaboScape یک نرم افزار تخصصی از Bruker برای پردازش، تحلیل و تفسیر داده های متابولومیکس، لیپیدومیکس و فنومیکس است. این نرم افزار به ویژه برای Workflow های Non-targeted طراحی شده و داده های حاصل از دستگاه های ESI LC-MS، سیستم های مجهز به Ion Mobility و تجهیزات MALDI را در یک محیط یکپارچه پردازش می کند.

هسته پردازش MetaboScape بر الگوریتم T-ReX استوار است که استخراج Feature، هم ترازی زمان بازداری، Deisotoping و پردازش داده های جرمی را انجام می دهد. در سیستم های timsTOF، اطلاعات Ion Mobility و مقدار CCS به داده های جرمی و MS/MS اضافه می شوند و امکان افزایش اطمینان در شناسایی ترکیبات و تفکیک ترکیبات مشابه فراهم می شود.

MetaboScape فرآیند شناسایی ترکیبات را از ترکیبات شناخته شده تا ترکیبات ناشناخته پوشش می دهد و از Formula تعیین شده با SmartFormula، تطبیق کتابخانه، Fragmentation محاسباتی، تحلیل شباهت طیفی و امتیازدهی Annotation Quality استفاده می کند. ابزارهای آماری مانند PCA، t-test، ANOVA و PLS نیز برای شناسایی Feature های مهم در مطالعات مقایسه ای در دسترس هستند.

این نرم افزار علاوه بر متابولومیکس، Workflow های تخصصی لیپیدومیکس، تحلیل متابولیت های دارویی و Xenobiotic، تحلیل سری زمانی، Batch Correction و پردازش داده های MALDI Imaging را پوشش می دهد. در نسخه های جدید، MetaboScape neXus نیز امکان ارتباط دادن Annotation های مطالعات مختلف و ایجاد یک Digital Metabolome Atlas را فراهم می کند.

قابلیت های نرم افزار MetaboScape

• استخراج Feature های متابولومیکس | Metabolomics Feature Extraction
  استخراج Feature های مولکولی از داده های طیف سنجی جرمی و آماده سازی آنها برای شناسایی و تحلیل آماری.
• پردازش T-ReX | T-ReX Data Processing
  هم ترازی زمان بازداری، Deisotoping و استخراج Feature برای پردازش پایدار داده های Non-targeted.
• شناسایی ترکیبات | Compound Identification
  تعیین فرمول مولکولی، جستجوی کتابخانه، بررسی طیف MS/MS و رتبه بندی ساختارهای کاندید.
• امتیازدهی کیفیت Annotation | Annotation Quality Scoring
  ترکیب شواهد جرمی، ایزوتوپی، MS/MS، زمان بازداری و در سیستم های مجهز به TIMS اطلاعات CCS برای ارزیابی اطمینان Annotation.
• تحلیل آماری متابولومیکس | Statistical Metabolomics Analysis
  تحلیل داده با روش هایی مانند PCA، t-test، ANOVA، PLS و Bucket Correlation برای شناسایی ترکیبات و Feature های مهم.
• تحلیل 4D لیپیدومیکس | 4D-Lipidomics Analysis
  Annotation مبتنی بر قواعد، استفاده از MS/MS و CCS و تحلیل ساختاری لیپیدها در داده های چندبعدی.
• تحلیل Kendrick Mass Defect | Kendrick Mass Defect Analysis
  نمایش و بررسی سری های همولوگ لیپیدی و تحلیل ارتباط جرم، ساختار و زنجیره های تکرارشونده.
• پیش بینی متابولیت های دارویی | Drug Metabolite Prediction
  شناسایی و پیش بینی متابولیت های داروها و Xenobiotic ها با استفاده از ابزارهای پیش بینی مبتنی بر BioTransformer.
• تحلیل سری زمانی و اصلاح Batch | Time Series & Batch Correction
  بررسی تغییرات متابولیت ها در طول زمان و اصلاح اثرات ناشی از Batch در مطالعات بزرگ.
• تفسیر زیستی و مسیرهای متابولیکی | Biological Pathway Mapping
  قرار دادن ترکیبات شناسایی شده در زمینه زیستی و بررسی ارتباط آنها با مسیرهای متابولیکی.

ماژول ها و افزونه های مهم MetaboScape

• ابزار T-ReX
  هسته استخراج و پردازش Feature در Workflow های متابولومیکس Non-targeted و داده های چندبعدی.
• Workflow چهار بعدی TIMS
  ترکیب m/z، زمان بازداری، MS/MS و CCS برای افزایش اطمینان در Annotation ترکیبات.
• 4D-Lipidomics
  مجموعه ابزارهای تخصصی Annotation و اعتبارسنجی لیپیدها با استفاده از قواعد ساختاری، MS/MS، CCS و Kendrick Mass Defect.
• SpatialOMx
  ترکیب MetaboScape با SCiLS Lab برای Annotation ترکیبات، لیپیدها و سایر Feature ها در داده های MALDI Imaging.
• MetaboBASE و کتابخانه های طیفی
  دسترسی به کتابخانه های ترکیبات برای شناسایی و Dereplication متابولیت ها و افزایش اطمینان Annotation.
• MetaboScape neXus
  ارتباط Annotation های معتبر میان پروژه ها و ایجاد یک Digital Metabolome Atlas برای استفاده مجدد از دانش مطالعات قبلی.

کاربردهای تخصصی در صنایع

• صنایع داروسازی و توسعه دارو
  شناسایی متابولیت های دارویی، بررسی Biomarker ها، تحلیل اثر دارو و مطالعه متابولیسم ترکیبات دارویی.
• صنایع غذایی و نوشیدنی
  بررسی ترکیبات متابولیتی، پروفایل شیمیایی مواد غذایی، مقایسه نمونه ها و شناسایی نشانگرهای مرتبط با کیفیت.
• صنایع زیست فناوری و تولید محصولات زیستی
  تحلیل تغییرات متابولیکی، بررسی فرآیندهای سلولی و شناسایی ترکیبات مرتبط با تغییر شرایط زیستی.
• صنایع شیمیایی و محیط زیست
  غربالگری Non-targeted ترکیبات و Xenobiotic ها و بررسی آلاینده ها و محصولات تبدیل شیمیایی در نمونه های پیچیده.
• صنایع کشاورزی و علوم گیاهی
  پروفایل متابولیتی گیاهان، بررسی پاسخ به تنش و شناسایی ترکیبات مرتبط با تغییرات فیزیولوژیک و محیطی.
• صنایع تشخیص و تحقیقات زیست پزشکی
  تحلیل Biomarker های متابولیکی و مقایسه نمونه های زیستی برای مطالعات بیماری، سمیت دارویی و تغییرات فیزیولوژیک.

✅ بیشتر بخوانید: LipidSearch تحلیل داده های لیپیدومیکس