Illumina DRAGEN 4.6.2 تحلیل داده های ژنومی و توالی یابی

نرم افزار Illumina DRAGEN یک پلتفرم بیوانفورماتیکی برای تحلیل ثانویه داده های توالی یابی نسل جدید (NGS) است که داده های خام ژنومی را به اطلاعات قابل استفاده برای بررسی تغییرات ژنتیکی تبدیل می کند.

این نرم افزار در تحلیل ژنوم کامل، اگزوم، ترنسکریپتوم و متیلاسیون DNA کاربرد دارد و فرایندهایی مانند همترازی توالی ها، شناسایی واریانت ها و پردازش داده های حجیم را در یک گردش کار یکپارچه انجام می دهد.

DRAGEN با پشتیبانی از پردازش شتاب یافته و استقرار در زیرساخت محلی، فضای ابری یا برخی دستگاه های توالی یابی، به آزمایشگاه ها و مراکز تحقیقاتی کمک می کند زمان پردازش و نیازهای محاسباتی تحلیل ژنومی را کاهش دهند.

خروجی های این نرم افزار در بررسی تغییرات ژنتیکی، مطالعات سرطان، تحقیقات بیماری های ارثی، ژنومیک جمعیت و تحلیل های چنداُمیکی استفاده می شوند و می توانند به عنوان ورودی مراحل بعدی تفسیر داده های ژنتیکی به کار روند.

قابلیت های نرم افزار Illumina DRAGEN

• تحلیل ژنوم کامل | Whole Genome Sequencing Analysis
• تحلیل اگزوم | Exome Sequencing Analysis
• همترازی توالی ها | Sequence Alignment
• شناسایی واریانت های ژنتیکی | Variant Calling
• تحلیل واریانت های ساختاری | Structural Variant Analysis
• تحلیل بیان ژن | RNA-Seq Analysis
• تحلیل متیلاسیون DNA | DNA Methylation Analysis
• تحلیل ژنومی سرطان | Somatic Variant Analysis
• پردازش داده های چنداُمیکی | Multiomics Analysis
• فشرده سازی داده های توالی یابی | Sequencing Data Compression

خطوط تحلیل و ابزارهای اصلی Illumina DRAGEN

• DRAGEN Germline Pipeline
  تحلیل داده های ژنومی برای شناسایی واریانت های ارثی و تولید خروجی های ژنوتایپی در مطالعات ژنتیک.
• DRAGEN Somatic Pipeline
  شناسایی تغییرات ژنتیکی اکتسابی در نمونه های توموری و تحلیل های ژنومی مرتبط با سرطان.
• DRAGEN RNA Pipeline
  پردازش داده های RNA-Seq برای بررسی بیان ژن و تحلیل های مرتبط با ترنسکریپتوم.
• DRAGEN Methylation Pipeline
  تحلیل داده های مرتبط با متیلاسیون DNA در مطالعات اپی ژنتیک.
• DRAGEN Structural Variant Calling
  شناسایی تغییرات ساختاری ژنوم، از جمله حذف، اضافه شدن و بازآرایی قطعات ژنتیکی.
• DRAGEN BCL Convert
  تبدیل داده های خروجی دستگاه های توالی یابی از قالب BCL به FASTQ برای مراحل بعدی تحلیل.
• DRAGEN ORA Compression
  فشرده سازی داده های FASTQ با قالب Original Read Archive برای کاهش فضای ذخیره سازی و تسهیل انتقال داده ها.
• DRAGEN Population Genomics
  پردازش داده های ژنومی در مطالعات جمعیتی و بررسی تنوع ژنتیکی در مجموعه های بزرگ نمونه.

کاربردهای تخصصی در صنایع

• مراکز ژنومیک و توالی یابی
  پردازش حجم بالای داده های حاصل از دستگاه های توالی یابی و آماده سازی خروجی برای تحلیل های بعدی.
• صنعت داروسازی و توسعه دارو
  پشتیبانی از مطالعات ژنومی و ترنسکریپتومی در تحقیقات کشف دارو و بررسی نشانگرهای زیستی.
• تحقیقات انکولوژی مولکولی
  تحلیل تغییرات ژنتیکی نمونه های توموری در پروژه های پژوهشی و مطالعات مولکولی.
• ژنتیک انسانی و بیماری های ارثی
  شناسایی واریانت های ژنتیکی در مطالعات بیماری های ارثی و تحقیقات ژنوم کامل و اگزوم.
• زیست فناوری و توسعه روش های آزمایشگاهی
  تحلیل داده های توالی یابی برای ارزیابی روش های مولکولی و توسعه گردش کارهای ژنومی.
• ژنومیک جمعیت و زیست شناسی تکاملی
  پردازش داده های گسترده ژنومی برای بررسی تنوع ژنتیکی، ساختار جمعیت و ارتباطات تکاملی.

✅ بیشتر بخوانید: Geneious Prime پلتفرم بیوانفورماتیک صنعتی