Imaris 11.1 تحلیل و پردازش تصاویر میکروسکوپی

نرم افزار Imaris محصول شرکت Oxford Instruments، یک راهکار تخصصی برای مشاهده، پردازش و تحلیل کمی تصاویر میکروسکوپی است. این نرم افزار به کاربران امکان می دهد تصاویر پیچیده حاصل از میکروسکوپ های کانفوکال، فلورسانس و Light-Sheet را به مدل های سه بعدی و چهار بعدی تبدیل کنند و ساختارهای سلولی، بافت ها و اجزای میکروسکوپی را با دقت بیشتری بررسی کنند.

یکی از کاربردهای اصلی Imaris، شناسایی و اندازه گیری خودکار سلول ها، هسته ها، ذرات و ساختارهای داخل سلولی است. به جای شمارش دستی یا اندازه گیری چشمی، می توان تعداد، حجم، سطح، قطر و سایر مشخصات اجسام را استخراج کرد و نتایج چندین نمونه را با یکدیگر مقایسه کرد. این قابلیت در تحلیل تصاویر حجیم و آزمایش هایی که به اندازه گیری های تکرارپذیر نیاز دارند، اهمیت زیادی دارد.

Imaris برای بررسی تغییرات زیستی در طول زمان نیز کاربرد دارد. ابزارهای ردیابی امکان دنبال کردن حرکت سلول ها، جابه جایی ذرات، تقسیم سلولی و تغییر شکل ساختارها را در تصاویر متوالی فراهم می کنند. همچنین می توان شبکه های پیچیده ای مانند نورون ها و رگ های خونی را بازسازی کرد و ویژگی هایی نظیر طول، قطر، تعداد شاخه ها و تراکم شبکه را اندازه گرفت.

این نرم افزار علاوه بر نمایش و تحلیل تصاویر، امکاناتی برای پردازش دسته ای، طبقه بندی مبتنی بر یادگیری ماشین، مقایسه آماری و استخراج گزارش دارد. در نتیجه، Imaris برای آزمایشگاه های تصویربرداری پیشرفته، مراکز تحقیقاتی، واحدهای توسعه دارو و تیم های زیست شناسی سلولی مناسب است؛ به ویژه زمانی که تحلیل دستی تصاویر زمان بر باشد یا به اندازه گیری های سه بعدی و قابل تکرار نیاز باشد.

قابلیت های نرم افزار Imaris

• نمایش سه بعدی و چهار بعدی | 3D and 4D Visualization
  مشاهده تصاویر حجیم و چندکاناله به صورت سه بعدی و بررسی تغییرات ساختارها در طول زمان.
• تشخیص و اندازه گیری اجسام | Object Detection and Measurement
  شناسایی سلول ها، هسته ها، ذرات و اجزای میکروسکوپی و محاسبه مشخصات هندسی آن ها.
• قطعه بندی سلول و بافت | Cell and Tissue Segmentation
  تفکیک ساختارهای مورد نظر از تصویر برای اندازه گیری حجم، سطح و ویژگی های هر بخش.
• ردیابی سلول ها و ذرات | Cell and Particle Tracking
  دنبال کردن حرکت اجسام در تصاویر زمان گریز و محاسبه سرعت، جابه جایی و مسیر حرکت.
• بازسازی نورون ها و شبکه های شاخه ای | Filament Tracing
  بازسازی سه بعدی نورون ها، رشته های سلولی و شبکه های عروقی و اندازه گیری طول، قطر و انشعاب ها.
• تحلیل هم مکانی | Colocalization Analysis
  بررسی میزان هم پوشانی سیگنال های فلورسانس برای ارزیابی توزیع و ارتباط مکانی نشانگرهای زیستی.
• تحلیل سلول و اجزای داخلی | Cellular and Subcellular Analysis
  تفکیک و اندازه گیری سلول، هسته، وزیکول ها و سایر ساختارهای داخل سلولی.
• پردازش دسته ای تصاویر | Batch Processing
  اجرای پروتکل های تحلیل روی مجموعه ای از تصاویر برای کاهش کار دستی و افزایش یکپارچگی نتایج.
• تحلیل آماری و مقایسه نمونه ها | Statistical Analysis
  مقایسه ویژگی های اندازه گیری شده میان گروه های آزمایشی و استخراج نمودارها و داده های آماری.
• بهبود کیفیت تصاویر | Image Deconvolution
  کاهش اثر تاری اپتیکی و افزایش وضوح تصاویر برای تشخیص بهتر ساختارهای نزدیک به هم، با استفاده از ابزارهای مربوطه.

ابزارها و اجزای اصلی نرم افزار Imaris

• Imaris Core
  محیط اصلی مشاهده تصاویر سه بعدی و چهار بعدی، ساخت مدل های حجمی و تهیه تصاویر و انیمیشن های علمی.
• Imaris Surfaces
  ابزار شناسایی و بازسازی اجسام حجمی مانند سلول ها، هسته ها، بافت ها و اندامک ها برای اندازه گیری کمی.
• Imaris Spots
  مناسب شناسایی اجسام کوچک مانند ذرات، وزیکول ها، خوشه های پروتئینی و مراکز سلولی.
• Imaris Filament Tracer
  ابزار بازسازی و تحلیل ساختارهای شاخه ای مانند نورون ها، دندریت ها، آکسون ها و شبکه های عروقی.
• Imaris Cell
  ابزار تفکیک و تحلیل سلول ها و بخش های داخلی آن ها برای بررسی ویژگی های سلولی در نمونه های میکروسکوپی.
• Imaris TrackLineage
  ابزار ردیابی اجسام در تصاویر متوالی و بررسی حرکت، تقسیم سلولی و ارتباط میان سلول های نسل های مختلف.
• Imaris Vantage
  محیط مقایسه آماری، ترسیم نمودار و بررسی نتایج استخراج شده از نمونه ها و گروه های آزمایشی.
• Imaris Batch
  اجرای خودکار پروتکل های ذخیره شده روی مجموعه تصاویر برای تحلیل تکرارپذیر و کاهش زمان پردازش.
• Imaris ClearView-GPU
  ابزار بهبود وضوح تصاویر میکروسکوپی با استفاده از پردازش مبتنی بر GPU و قابلیت اجرای دسته ای.
• Imaris Stitcher
  ترکیب تصاویر مجاور حاصل از تصویربرداری چندناحیه ای برای ساخت یک تصویر بزرگ و یکپارچه دو بعدی یا سه بعدی.

کاربردهای تخصصی در صنایع

• صنایع داروسازی و توسعه دارو
  تحلیل تصاویر سلولی و بافتی برای بررسی پاسخ سلول ها به ترکیبات دارویی، ارزیابی اثر درمان و مقایسه گروه های آزمایشی.
• صنایع زیست فناوری و مهندسی سلولی
  اندازه گیری رشد سلول، بررسی تقسیم و مهاجرت سلولی و ارزیابی ساختارهای سه بعدی در کشت سلول و ارگانوئیدها.
• صنایع تجهیزات پزشکی و تشخیص آزمایشگاهی
  تحلیل تصاویر میکروسکوپی برای ارزیابی نمونه های زیستی، بررسی ساختار بافت و توسعه روش های تصویربرداری و تحلیل داده.
• صنایع پزشکی بازساختی و مهندسی بافت
  بررسی ساختار داربست های زیستی، توزیع سلول ها و رشد شبکه های عروقی در نمونه های مهندسی بافت.
• صنایع زیست مواد و مواد زیست سازگار
  ارزیابی تعامل سلول ها با سطوح و مواد زیستی و بررسی چسبندگی، توزیع و مورفولوژی سلول ها در مطالعات سازگاری زیستی.
• آزمایشگاه های تصویربرداری و مراکز تحقیقاتی علوم اعصاب
  بازسازی نورون ها و شبکه های عصبی و اندازه گیری طول شاخه ها، تراکم دندریت ها و تغییرات ساختاری در نمونه های عصبی.

✅ بیشتر بخوانید: Imalytics Preclinical تحلیل تصاویر پزشکی پیش بالینی