LAMP Designer 1.16 طراحی پرایمر LAMP و آزمون ایزوترمال

نرم افزار LAMP Designer محصول شرکت Premier Biosoft یک نرم افزار تخصصی برای طراحی پرایمرهای مورد نیاز در فناوری Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP) است. این فناوری یکی از روش های پیشرفته تکثیر DNA و RNA در دمای ثابت بوده و به دلیل سرعت بالا، حساسیت زیاد و عدم نیاز به تجهیزات پیچیده PCR، در توسعه آزمون های تشخیص مولکولی سریع کاربرد گسترده ای پیدا کرده است. LAMP Designer به پژوهشگران و شرکت های تولیدکننده کیت های تشخیصی کمک می کند تا مجموعه پرایمرهای LAMP شامل F3، B3، FIP، BIP و Loop Primers را با دقت بالا طراحی و بهینه سازی کنند.

طراحی پرایمر در روش LAMP برخلاف PCR معمولی پیچیدگی بیشتری دارد؛ زیرا عملکرد صحیح واکنش به هماهنگی چندین پرایمر در یک ناحیه هدف وابسته است. LAMP Designer با تحلیل توالی هدف، انتخاب نواحی مناسب، بررسی دمای ذوب، درصد GC، ساختارهای ثانویه، احتمال تشکیل Dimer و اختصاصیت توالی، بهترین طراحی پرایمر را برای انجام واکنش های ایزوترمال پیشنهاد می دهد. این قابلیت باعث کاهش خطا در توسعه آزمون و افزایش حساسیت و اختصاصیت تست های تشخیصی می شود.

این نرم افزار برای طراحی آزمون های Real-Time LAMP، Colorimetric LAMP و Fluorescent LAMP کاربرد دارد و می تواند در توسعه روش های تشخیص سریع بیماری های عفونی، شناسایی عوامل بیماری زا، تست های قابل حمل (Point-of-Care)، تحقیقات ژنتیکی و مطالعات زیست فناوری مورد استفاده قرار گیرد. امکان بررسی توالی های مختلف و طراحی پرایمرهای اختصاصی، آن را به ابزاری مناسب برای توسعه کیت های تشخیص مولکولی تبدیل کرده است.

یکی از مزیت های مهم LAMP Designer، کاربرد آن در توسعه نسل جدید آزمون های تشخیصی است که نیاز به سرعت بالا، هزینه پایین و تجهیزات آزمایشگاهی کمتر دارند. این ویژگی باعث شده است فناوری LAMP در حوزه هایی مانند تشخیص ویروس ها، باکتری ها، انگل ها، تشخیص محصولات تراریخته، کنترل کیفیت مواد غذایی و آزمایش های میدانی مورد توجه قرار گیرد.

امروزه LAMP Designer در شرکت های تولیدکننده کیت های تشخیص مولکولی، آزمایشگاه های زیست شناسی مولکولی، مراکز تحقیقاتی، صنایع بیوتکنولوژی، آزمایشگاه های پزشکی و مراکز توسعه فناوری های تشخیصی برای طراحی پرایمرهای LAMP، توسعه آزمون های سریع و بهینه سازی روش های تکثیر ایزوترمال استفاده می شود.

قابلیت‌های نرم افزار LAMP Designer

• طراحی پرایمرهای LAMP | LAMP Primer Design
  طراحی مجموعه کامل پرایمرهای LAMP شامل F3، B3، FIP، BIP و Loop Primer برای واکنش های تکثیر ایزوترمال.
• طراحی آزمون های تشخیص سریع | Rapid Molecular Assay Design
  توسعه آزمون های سریع تشخیص DNA و RNA برای کاربردهای پزشکی، تحقیقاتی و صنعتی.
• تحلیل اختصاصیت توالی | Sequence Specificity Analysis
  بررسی اختصاصیت نواحی هدف و کاهش احتمال اتصال غیر اختصاصی پرایمرها.
• بهینه سازی پارامترهای پرایمر | Primer Optimization
  ارزیابی Tm، درصد GC، طول پرایمر و سایر پارامترهای مؤثر بر عملکرد واکنش.
• تحلیل ساختارهای ثانویه | Secondary Structure Analysis
  شناسایی Hairpin، Dimer و ساختارهایی که می توانند راندمان واکنش LAMP را کاهش دهند.
• طراحی آزمون های Fluorescent و Colorimetric LAMP | Detection Assay Design
  پشتیبانی از طراحی آزمون های مبتنی بر سیگنال فلورسنت یا تغییر رنگ.
• شناسایی عوامل بیماری زا | Pathogen Detection Design
  طراحی پرایمر برای تشخیص ویروس ها، باکتری ها و سایر عوامل میکروبی.
• طراحی آزمون های Multiplex | Multiplex LAMP Design
  کمک به توسعه آزمون هایی با قابلیت شناسایی چند هدف ژنتیکی.
• تحلیل چندین توالی ژنتیکی | Multiple Sequence Analysis
  مقایسه توالی های مختلف برای یافتن نواحی محافظت شده و اختصاصی.
• اعتبارسنجی طراحی پرایمر | Primer Validation
  ارزیابی کیفیت طراحی قبل از سنتز پرایمر و انجام آزمایش عملی.

کاربردهای تخصصی در صنایع

• شرکت های تولیدکننده کیت های تشخیص مولکولی
  به منظور طراحی و توسعه کیت های LAMP برای تشخیص سریع عوامل بیماری زا، تست های پزشکی و آزمون های قابل حمل.
• آزمایشگاه های تشخیص پزشکی
  به منظور توسعه روش های سریع تشخیص ویروس ها، باکتری ها، بیماری های عفونی و آزمایش های ژنتیکی.
• صنایع داروسازی و بیوتکنولوژی
  به منظور توسعه فناوری های تشخیص مولکولی، تحقیقات ژنتیکی و طراحی آزمون های زیستی.
• صنایع غذایی و کشاورزی
  به منظور تشخیص آلودگی های میکروبی، شناسایی گونه ها، کنترل کیفیت مواد غذایی و تشخیص عوامل بیماری زای گیاهی.
• دامپزشکی و علوم زیستی
  به منظور طراحی آزمون های سریع برای شناسایی بیماری های دام، طیور و آبزیان.