Primer Premier 6.25 طراحی کیت PCR جهت آزمایشهای ژنتیکی

نرم افزار Primer Premier محصول شرکت Premier Biosoft یکی از شناخته شده ترین نرم افزارهای طراحی پرایمر و پروب برای آزمایش های PCR، Real-Time PCR (qPCR)، Multiplex PCR، Sequencing و Genotyping است. این نرم افزار با بهره گیری از الگوریتم های پیشرفته، امکان طراحی پرایمرهای اختصاصی با دقت بالا را فراهم می کند و به پژوهشگران کمک می کند تا واکنش های تکثیر DNA با بیشترین اختصاصیت، راندمان و قابلیت تکرار طراحی شوند. Primer Premier سال هاست در آزمایشگاه های زیست شناسی مولکولی، ژنتیک، بیوتکنولوژی، تشخیص مولکولی و صنایع دارویی به عنوان یکی از نرم افزارهای مرجع طراحی پرایمر مورد استفاده قرار می گیرد.

این نرم افزار تنها به طراحی پرایمر محدود نمی شود، بلکه مجموعه کاملی از ابزارهای ارزیابی و بهینه سازی را نیز در اختیار کاربران قرار می دهد. Primer Premier ساختارهای ثانویه، Hairpin، Self-Dimer، Cross-Dimer، دمای ذوب (Tm)، درصد GC، اختصاصیت توالی، احتمال ایجاد محصولات ناخواسته و سایر پارامترهای مؤثر بر عملکرد واکنش PCR را به صورت خودکار بررسی می کند. این قابلیت ها باعث می شوند پیش از انجام آزمایش، کیفیت پرایمرها به طور کامل ارزیابی شده و احتمال شکست آزمایش به حداقل برسد.

یکی از مهم ترین قابلیت های Primer Premier، طراحی پرایمر برای پروژه های پیچیده مانند Multiplex PCR، تعیین ژنوتیپ، تشخیص SNP، توالی یابی DNA، شناسایی عوامل بیماری زا، تحقیقات ژنتیکی و توسعه کیت های تشخیص مولکولی است. نرم افزار با تحلیل همزمان چندین توالی، بهترین مجموعه پرایمرها را پیشنهاد داده و از ایجاد تداخل بین آن ها جلوگیری می کند. همچنین امکان طراحی انواع پروب های فلورسنت برای آزمایش های Real-Time PCR و توسعه روش های تشخیصی نیز در این نرم افزار فراهم شده است.

امروزه Primer Premier در شرکت های بیوتکنولوژی، صنایع داروسازی، آزمایشگاه های ژنتیک، مراکز تشخیص مولکولی، مراکز تحقیقاتی، دانشگاه ها و شرکت های تولیدکننده کیت های تشخیصی برای طراحی پرایمر، توسعه روش های PCR، تحقیقات ژنومی، مطالعات بیان ژن، تشخیص بیماری های ژنتیکی و توسعه آزمون های مولکولی مورد استفاده قرار می گیرد و یکی از معتبرترین نرم افزارهای این حوزه به شمار می رود.

قابلیت‌های نرم افزار Primer Premier

• طراحی پرایمر برای PCR و qPCR | PCR & qPCR Primer Design
  طراحی پرایمرهای اختصاصی برای PCR معمولی، Real-Time PCR، RT-PCR و Digital PCR با در نظر گرفتن پارامترهای استاندارد طراحی.
• طراحی Multiplex PCR | Multiplex Primer Design
  طراحی همزمان چندین جفت پرایمر برای واکنش های Multiplex PCR و جلوگیری از تداخل میان پرایمرها.
• طراحی پروب های فلورسنت | Probe Design
  طراحی انواع پروب های TaqMan، Molecular Beacon، FRET و سایر پروب های مورد استفاده در آزمایش های Real-Time PCR.
• تحلیل اختصاصیت پرایمر | Primer Specificity Analysis
  بررسی اختصاصیت اتصال پرایمرها به توالی هدف و کاهش احتمال تکثیر غیر اختصاصی.
• آنالیز ساختارهای ثانویه | Secondary Structure Analysis
  شناسایی Hairpin، Self-Dimer، Cross-Dimer و سایر ساختارهای ثانویه که می توانند راندمان PCR را کاهش دهند.
• بهینه سازی دمای اتصال | Annealing Temperature Optimization
  محاسبه دمای ذوب (Tm)، درصد GC و سایر پارامترهای مؤثر برای دستیابی به بیشترین راندمان واکنش.
• طراحی پرایمر برای تعیین ژنوتیپ | Genotyping Primer Design
  طراحی پرایمرهای تخصصی برای مطالعات ژنتیکی، تشخیص SNP، بررسی جهش ها و تعیین ژنوتیپ.
• طراحی پرایمر برای تعیین توالی | Sequencing Primer Design
  طراحی پرایمرهای مناسب برای پروژه های DNA Sequencing و تأیید نتایج توالی یابی.
• طراحی آزمون های تشخیص مولکولی | Molecular Diagnostic Assay Design
  توسعه پرایمرها و پروب های مورد نیاز برای کیت های تشخیص بیماری های عفونی، ژنتیکی و آزمایش های مولکولی.
• تحلیل و اعتبارسنجی پرایمرها | Primer Quality Assessment
  ارزیابی کامل کیفیت طراحی، احتمال تشکیل محصولات ناخواسته و انتخاب بهترین پرایمر پیش از انجام آزمایش.

کاربردهای تخصصی در صنایع

• صنایع داروسازی و بیوتکنولوژی
  به منظور توسعه روش های تشخیص مولکولی، طراحی آزمون های PCR و توسعه کیت های تشخیصی.
• آزمایشگاه های ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
  به منظور طراحی پرایمر برای مطالعات ژنتیکی، بررسی جهش ها، تعیین ژنوتیپ و تحقیقات DNA.
• مراکز تشخیص مولکولی
  به منظور طراحی آزمون های تشخیص بیماری های ویروسی، باکتریایی، ژنتیکی و سرطان.
• مراکز تحقیقاتی و دانشگاه ها
  به منظور انجام پروژه های ژنومیکس، بیان ژن، کلونینگ، توالی یابی و تحقیقات مولکولی.
• شرکت های تولیدکننده کیت های تشخیصی
  به منظور توسعه و اعتبارسنجی پرایمرها و پروب های مورد استفاده در کیت های PCR و Real-Time PCR.